საბჭო არის მართვის განმახორციელებელი კოლეგიური ორგანო, რომელიც განსაზღვრავს ასოციაციის საქმიანობის ძირითად პრიორიტეტებს, მიზნებსა და სტრატეგიას.საბჭოს საქმიანობა რეგულირდება საქართველოს კანონით „მედიაციის შესახებ“ და ასევე ასოციაციის წესდებით.საბჭო შედგება არანაკლებ 8 წევრისაგან. საბჭოს წევრებს 4 წლის ვადით ირჩევს ასოციაციის საერთო კრება. საბჭოს წევრთა საქმიანობა არ ანაზღაურდება. ასოციაციის თავმჯდომარე თანამდებობრივად (ex officio) არის საბჭოს წევრი და ხელმძღვანელობს მას.